虽然很多人喊着农资行业越来越难做，整体看整个农资招商市场还是处于一片繁荣状态。但是在热闹的表象下，很多一直存在的问题却被所有人都视而不见，持续的对整个农资加盟行业造成负面影响。
    创新型肥料是近年来农资行业的一个热词，越来越严重的产品同质化问题让农资代理商想要保持竞争力，必须代理有特点的创新型产品。能够创新当然是好事，但大多数企业都是挂羊头卖狗肉，打着创新产品的幌子，实际只是将老产品换了一下包装。这种创新产品大多会被农资招商企业编一些似是而非的新概念，连专业技术人员都看不明白，通过各种忽悠向农户销售。因为市面上假的创新产品太多，让农户对新型产品失去了信心，对农资代理商推荐的所谓创新产品非常抗拒。这种情况极大的扰乱了市场秩序，对实实在在做创新的企业会造成很大损害，打击了这些企业进行新品研发的积极性。
    赊销问题一直是农资行业难以解决的顽疾，不止是厂家和代理商头疼，农资加盟店同样十分头疼。当前大部分农资产品都是以赊销的方式进行售卖，想要现款结账难度不是一般的大。每次临近年底，农资行业到处都是一片催债声。赊销难以杜绝，一部分原因是因为农业收获很难保持稳定，农户希望通过赊销让农资代理商来分担部分风险，不愿意进行现金结算；另一部分原因就是因为企业很难拒绝销售更多产品的诱惑，即使知道赊销回款难，依旧抱有侥幸心理，觉得只要卖出去就相当于成功盈利，总比将产品堆在仓库里强。所以虽然很多农资招商企业一边不断的声讨赊销，一边继续以赊销的方式进行销售。然而赊销对于大多数实力不足的企业来说，并不能真正转化成利益，更多的是被赊销问题最终拖垮。

    大多农资企业热衷以会议的形式进行营销，不管是让代理商、农资加盟商拿货，还是直接销售给农户，都会选择开会。近年来，行业中各种会议的组织越来越正规，也越来越盛大。各种峰会、论坛都会吸引不少媒体进行报道，的确给企业带来不少宣传，但是一般农户很少会关注这些。对于他们来说，说的再好都不如做出一次实际成果，然而却很少有企业愿意去做实验田来展示产品的效用。